A Trypanosoma cruzi codon table.

(by the Kazusa DNA Research Institute, Japan).

(format suitable for GCG codonfrequency program)

Trypanosoma cruzi [gbinv]: 289 CDS's (128116 codons)


AmAcid  Codon      Number    /1000     Fraction   ..
 
Gly     GGG      1849.00     14.43      0.20
Gly     GGA      1568.00     12.24      0.17
Gly     GGT      2529.00     19.74      0.27
Gly     GGC      3531.00     27.56      0.37
 
Glu     GAG      5814.00     45.38      0.66
Glu     GAA      3035.00     23.69      0.34
Asp     GAT      2670.00     20.84      0.42
Asp     GAC      3625.00     28.29      0.58
 
Val     GTG      4864.00     37.97      0.50
Val     GTA       731.00      5.71      0.08
Val     GTT      2394.00     18.69      0.25
Val     GTC      1704.00     13.30      0.18
 
Ala     GCG      3987.00     31.12      0.33
Ala     GCA      2379.00     18.57      0.20
Ala     GCT      2269.00     17.71      0.19
Ala     GCC      3293.00     25.70      0.28
 
Arg     AGG       976.00      7.62      0.13
Arg     AGA       487.00      3.80      0.06
Ser     AGT      1462.00     11.41      0.15
Ser     AGC      2003.00     15.63      0.21
 
Lys     AAG      5076.00     39.62      0.72
Lys     AAA      1994.00     15.56      0.28
Asn     AAT      2026.00     15.81      0.43
Asn     AAC      2718.00     21.22      0.57
 
Met     ATG      3143.00     24.53      1.00
Ile     ATA       643.00      5.02      0.13
Ile     ATT      2535.00     19.79      0.49
Ile     ATC      1952.00     15.24      0.38
 
Thr     ACG      3493.00     27.26      0.41
Thr     ACA      1853.00     14.46      0.22
Thr     ACT      1437.00     11.22      0.17
Thr     ACC      1828.00     14.27      0.21
 
Trp     TGG      1521.00     11.87      1.00
End     TGA       161.00      1.26      0.55
Cys     TGT       764.00      5.96      0.34
Cys     TGC      1511.00     11.79      0.66
 
End     TAG        68.00      0.53      0.23
End     TAA        64.00      0.50      0.22
Tyr     TAT       869.00      6.78      0.28
Tyr     TAC      2277.00     17.77      0.72
 
Leu     TTG      1880.00     14.67      0.17
Leu     TTA       598.00      4.67      0.05
Phe     TTT      2866.00     22.37      0.61
Phe     TTC      1819.00     14.20      0.39
 
Ser     TCG      1745.00     13.62      0.18
Ser     TCA      1175.00      9.17      0.12
Ser     TCT      1316.00     10.27      0.14
Ser     TCC      1741.00     13.59      0.18
 
Arg     CGG      1269.00      9.91      0.16
Arg     CGA       833.00      6.50      0.11
Arg     CGT      1797.00     14.03      0.23
Arg     CGC      2434.00     19.00      0.31
 
Gln     CAG      2983.00     23.28      0.70
Gln     CAA      1249.00      9.75      0.30
His     CAT       992.00      7.74      0.36
His     CAC      1727.00     13.48      0.64
 
Leu     CTG      3769.00     29.42      0.34
Leu     CTA       435.00      3.40      0.04
Leu     CTT      2541.00     19.83      0.23
Leu     CTC      1884.00     14.71      0.17
 
Pro     CCG      1938.00     15.13      0.33
Pro     CCA      1450.00     11.32      0.24
Pro     CCT      1013.00      7.91      0.17
Pro     CCC      1559.00     12.17      0.26


Coding GC 54.97% 1st letter GC 57.85% 2nd letter GC 44.62% 3rd letter GC 62.43%
Genetic code 1: Standard